Geneformics發(fā)布基因組測序數(shù)據(jù)壓縮方案

　　Geneformics D大幅提高基因組數(shù)據(jù)在云端上傳、下載、存儲及備份的效率(最高可達原來的10倍)

　　美國加州森尼韋爾市——Geneformics數(shù)據(jù)系統(tǒng)有限公司(以下簡稱“Geneformics”)是基因組IT架構(gòu)領(lǐng)導(dǎo)者之一，專注于提高第二代測序(NGS)數(shù)據(jù)的傳輸、存儲及備份的效率。Geneformics今日正式發(fā)布Geneformics D，一款專為基因組數(shù)據(jù)設(shè)計的分布式云端壓縮解決方案。Geneformics D將基因數(shù)據(jù)上傳，下載，存儲和備份的速度及效率提高近10倍，同時降低90%的成本。

　　與現(xiàn)有應(yīng)用不同，Geneformics D被整合到云端架構(gòu)中，從而提供無縫,可拓展服務(wù)，而非生硬地作為一款應(yīng)用添加于基因組工作流程中。

　　Geneformics D基于Geneformics與以色列魏茨曼研究所共同研發(fā)的無損壓縮技術(shù)，可為基因組云端程序提供企業(yè)級的基礎(chǔ)設(shè)施服務(wù)(IaaS)。運用Geneformics D技術(shù)，從人群測序、基因庫、遺傳、罕見疾病、癌癥和基因組學(xué)藥物治療研究中提取的精準醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)可被自動壓縮，這一過程對用戶透明，從而高效地節(jié)省時間，帶寬及大量存儲空間。

　　Geneformics CEO Rafael Feitelber 表示：“精準醫(yī)學(xué)正在促使醫(yī)療及研究機構(gòu)將基因組數(shù)據(jù)分析過程從本地向云端架構(gòu)遷移， 因為云端架構(gòu)的高可擴展性，共享性和易用性更具有吸引力�，F(xiàn)在,通過Geneformics D技術(shù)，相關(guān)機構(gòu)可以通過云端高可擴展的無縫基因組數(shù)據(jù)壓縮大大加快數(shù)據(jù)分析流程，減少儲存需求。

　　Geneformics公司的創(chuàng)始人兼CTO Arik Keshet表示：“單個人類全基因組測序的數(shù)據(jù)量大約為250-300GB，Geneformics目前致力解決海量數(shù)據(jù)給第二代測序從業(yè)人員所帶來的巨大挑戰(zhàn)。通過使用Geneformics D技術(shù)，經(jīng)壓縮的全基因組數(shù)據(jù)大小僅有原來的十分之一。同時，由于Geneformics D技術(shù)與底層架構(gòu)的無縫整合，使得用戶不需要改變?nèi)魏蔚臄?shù)據(jù)格式和應(yīng)用接口。

　　Geneformics D采用分布式的、云端壓縮文件系統(tǒng)，目前已整合至亞馬遜網(wǎng)絡(luò)服務(wù)(AWS),Geneformics D未來版本將會陸續(xù)整合其他云服務(wù)提供商。Geneformics D軟件安裝在每個計算實例上，協(xié)同實現(xiàn)一個對象即文件(object-as-file)，經(jīng)過透明壓縮的Linux標準文件系統(tǒng)。Geneformics D動態(tài)解壓縮技術(shù)讓采用原生FASTQ和BAM格式的數(shù)據(jù)分析應(yīng)用不需修改即可使用，從而保證對生物信息流程的影響最小。

　　其他Geneformics D功能包括：

　　在實例連接的磁盤上，智能緩存解壓文件段，并加速數(shù)據(jù)分析進程。

　　與計算基礎(chǔ)架構(gòu)的無縫整合，具有幾乎無限的拓展能力。

　　自動化云端基因組數(shù)據(jù)存儲管理(專利申請中)，可將數(shù)據(jù)引導(dǎo)至最具成本效益的存儲層。通過細粒度的對象儲存分層，在空間壓縮的成本節(jié)省的基礎(chǔ)上還可以再節(jié)約高達50%的成本。

　　更多Geneformics信息和演示請求，請訪問網(wǎng)站www.geneformics.com.

　　Geneformics是基因組數(shù)據(jù)管理和壓縮技術(shù)的全球領(lǐng)導(dǎo)者之一。Geneformics依托生物信息學(xué)家、計算機工程師及以色列魏茨曼研究所共同開發(fā)的專有技術(shù)，降低大數(shù)據(jù)的復(fù)雜性，使得可以輕松訪問海量基因組數(shù)據(jù)。公司的解決方案已被全球多家公司采用，以優(yōu)化數(shù)據(jù)傳輸、存儲和備份，推動精準醫(yī)學(xué)發(fā)展。Geneformics在美國硅谷和以色列均設(shè)有辦事處，由國際知名的風險投資基金提供資金保障。